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一种基于靶向测序的枸杞S基因的快速分型鉴定方法
本发明涉及一种基于靶向测序的枸杞S基因的快速分型鉴定方法,依据若干参考枸杞品种的S基因设计探针,利用设计的探针组合物对待测枸杞样品的基因进行杂交捕获、测序分析,并将测序结果与参考枸杞品种的S基因进行比对,判断待测枸杞样品的S基因与所述参考枸杞品种的S基因是否匹配,确定待测枸杞样品S基因所匹配的参考枸杞品种。本发明针对多个待测SNP位点设计特异性扩增引物,利用靶向测序分型(GBTS)技术,实现枸杞S-RNase基因的快速分型鉴定。
基于细菌16S rRNA基因序列的细菌“种”水平检测和分析方法
本发明公开一种非诊断目的的基于细菌16S rRNA基因序列在“种”(species)水平上鉴定人体肠道菌群的方法。所述方法包括:(1)构建基于细菌操作系统发生学单元为基础的人肠道菌群16S rRNA基因参比序列库,(2)对待检测标本的16S rRNA基因进行序列测定;(3)将标本16S rRNA基因序列与16S rRNA基因参比序列库进行比对并进行菌种鉴定。本发明的方法可将人肠道菌群检测注释到“种”的水平,并揭示其多样性、构成比、丰度等数据。这些数据可用于分析人的肠道菌群是否失调,可发现是否存在已知病原菌、潜在致病菌等,可分析肠道益生菌的种类和丰度,可分析肠道菌群紊乱与健康状态、疾病等的相关性。
一种基于高通量测序的病原微生物多重扩增试剂盒和方法
本发明涉及物种鉴定技术,特别是一种基于高通量测序的病原微生物多重扩增试剂盒和方法,其特征在于,所述试剂盒包含细菌通用引物。基于这些通用引物组合对待测样品进行单管多重扩增,能够保证尽可能多的扩增出目标物种,同时又要保证所扩增的片段有足够的变异能够区分不同物种,是高通量测序及进行物种分析的基础。
基于药物基因多态性及血栓弹力图的血小板治疗指导方法
本发明涉及血小板技术领域,尤其涉及一种基于药物基因多态性及血栓弹力图的血小板治疗指导方法,包括以下步骤:S1、药物基因检测;S2、全血基因组DNA测序;S3、进行代谢型分类;S4、TEG检测;S5、结果分析,本发明中,根据药物基因多态性联合TEG指导轻型缺血性卒中抗血小板治疗能有效降低90d内新发卒中风险,且不会增加出血风险。基因检测联合TEG可及时发现对抗血小板药物治疗不敏感的患者,能为抗血小板治疗药物的选择提供新的依据,使缺血性卒中患者能更加精准、合理地选择抗血小板药物,从而制定个体化的抗血小板治疗方案,有效降低卒中复发的风险,对于缺血性卒中二级预防具有重要的指导意义,值得临床推广应用。
一种复杂疾病相关SNP位点引物组合物及应用
本发明提供了一种复杂疾病相关SNP位点引物组合物及其应用,属于分子生物学技术领域。本发明通过NGS的方法,设计开发了一组SNP位点扩增引物,通过生物信息学分析方法,检测个体体内与复杂疾病相关的基因结构变化,预测个体患病风险,提高复杂疾病的预防和/或治疗效果。本发明所述的评估系统及检测方法成本低,操作简便,灵敏度好,且准确率高,重复性好,具有极大的临床应用价值。
药物和营养代谢能力检测SNP位点引物组合物及应用
本发明提供了一种药物和营养代谢能力检测SNP位点引物组合物及其应用,属于分子生物学技术领域。本发明通过NGS的方法,设计开发了一组SNP位点扩增引物,通过生物信息学分析方法,检测个体体内与代谢相关的基因结构变化,从而指导人们对药物的选择使用和对营养物质的摄入选择。本申请所述的引物组合物及检测方法检测成本低,操作简便,灵敏度好,且准确率高,重复性好,具有极大的临床应用价值。
基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法及应用
本发明涉及一种基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法及应用。所述微生物种群鉴定方法,通过对微生物的目标片段进行三核苷酸和单核苷酸循环的测序反应,得到测序图谱,根据测序图谱绘制比色带,通过分析比色带或/和测序图谱确定微生物种类;所述三核苷酸为dATPαS、dCTP、dTTP、dGTP中的任意三种核苷酸;所述单核苷酸为不包括早三核苷酸中的另一核苷酸。本发明微生物种群鉴定方法缩短了检测时间,且可通过分析比色带或/和检测图谱,得出检测结果,简化了数据分析过程。本发明微生物种群鉴定方法的应用还包括对定向突变位点的测序。
聚合酶组合物和制造与使用其的方法
本发明提供适用于核酸聚合的组合物、方法、套组、系统和设备。确切地说,提供允许得到改进的核酸扩增的经过修饰的聚合酶和其生物活性片段,如经过修饰的Taq聚合酶。在一些方面,本发明提供具有与参考Taq聚合酶相比改进的热稳定性、精确度、持续合成能力和/或读取长度的经过修饰的聚合酶。在一些方面,本发明涉及适用于扩增方法并且在实际说明性实施例中适用于乳液PCR的经过修饰的聚合酶或其生物活性片段。
一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法
本发明公开了一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,1)配制试剂与培养基,2)组织预处理,3)组织消化解离,4)终止消化,5)μm细胞过滤器过滤,6)获取目的组织单细胞悬液;7)测活细胞得率,本发明制备鱼类组织单细胞悬液的方法,能够实现低成本、快速、高效获得鱼类组织单细胞悬液,并保证解离的细胞保持良好活率,可应用于大范围的鱼类细胞的解离、分离纯化以及细胞系的建立,为鱼类单细胞、基因功能及遗传育种研究提供重要参考资料。
从复杂样本中富集真菌的方法及其在真菌研究中的应用
本发明涉及微生物领域,具体涉及一种从复杂样本中富集真菌的方法及其在真菌研究中的应用。该方法包括:1)从所述复杂样本去除粒径大于100μm的物质后,通过0.8-1.0μm的滤膜对其进行浓缩,以得到浓缩样本;2)裂解所述浓缩样本中的细菌,而后在DNase作用下去除细菌核酸。本发明可以实现对人体或动物粪便样本中真菌及其核酸的富集,减少细菌核酸占比,使富集后样本可以应用于靶向真菌的扩增子、宏基因组以及宏转录组分析。此外,本发明还可以应用于任何由于细菌丰度高掩盖真菌信息的复杂样本,实现对真菌的富集。