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最新技术
基于KASP技术开发的不结球白菜核心SNP分子标记集及其应用
本发明属于分子生物学及植物分子育种技术领域,具体涉及基于KASP技术开发的不结球白菜核心SNP分子标记集及其应用,为开发一种快速、准确、有效的不结球白菜种质和品种鉴定评价方法,本发明基于KASP技术开发了不结球白菜的核心SNP分子标记集,该SNP分子标记集能够快速、准确、有效地鉴定评价种质资源材料或者育成品种,可以解决因大量种质积累而带来的资源冗余、保存管理不便以及知识产权纠纷等问题,为遗传图谱构建、基因定位、分子辅助育种等提供分子标记。
用于辨别菊花白色锈病抗性的CAPS分子标记及其应用
本发明涉及一种用于辨别菊花白色锈病抗性的分子标记,所述分子标记为酶切扩增多态性序列(CAPS),所述酶切扩增多态性序列(CAPS)的原始序列的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:1,下游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:2。本发明的分子标记在菊花任意发育时期均可用于辨别菊花白色锈病抗性,在菊花白色锈病抗性鉴定与抗病品种选育方面具有重要的科学指导意义。
一种检测耶氏肺孢子菌及其耐药突变的引物探针组合及其应用
本发明提供了一种检测耶氏肺孢子菌及其耐药突变的引物探针组合及其应用,所述检测耶氏肺孢子菌及其耐药突变的引物探针组合包括扩增并检测二氢叶酸合成酶基因的引物对和探针;扩增所述二氢叶酸合成酶基因的引物对包括SEQ ID No.1~2所示的核苷酸序列,检测所述二氢叶酸合成酶基因的探针包括SEQ ID No.3所示的核苷酸序列。本发明还提供了一种检测耶氏肺孢子菌及其耐药突变的试剂盒及其以非疾病诊断和/或治疗为目的的使用方法以及一种检测耶氏肺孢子菌及其耐药突变的装置。所述引物探针组合特异性好,灵敏度高,所述试剂盒设计合理,使用方便,应用前景广阔。
用于ADTKD基因突变检测的引物、试剂盒及分析方法
本发明涉及用于ADTKD基因突变检测的引物、试剂盒及分析方法。本发明技术方案包括:PCR引物设计、替换的磁珠、酶和适用的体系设计等。本发明通过一系列试剂的优化筛选,实现了不同样本、不同机型等的基因突变检测。本发明中的方法靶向五个基因的基因区段,测序长度在1.6kbp到3kbp之间,无需将基因达成300bp左右的短片段,直接获得靶向全长序列,同时通过循环一致序列分析,对于突变和indel的检测准确度更高。尤其对于MUC1基因,该方法克服了WES无法准确拼接比对该基因重复区域的缺点,能够获得准确的循环一致序列,直观鉴定重复区域个数和突变位点,解决了WES无法检测该基因突变的难题。
一种用于他汀类药物疗效预测的检测试剂盒及其检测方法和应用
本发明公开了一种用于他汀类药物疗效预测的检测试剂盒及其检测方法和应用,其中,所述试剂盒用于检测他汀类药物疗效相关基因ApoE T388C和ApoE C526T两个基因的多态性,试剂盒包括如下组分:扩增反应液、ApoE T388C扩增引物、APOE T388C测序引物、ApoE C526T扩增引物、ApoE C526T测序引物和阳性对照。本发明采用多重RPA扩增和优化焦磷酸测序技术为组合对他汀类药物疗效的相关的基因多态性进行检测,试剂盒可同时检测ApoE(T388C)、ApoE(C526T)基因多态性汀类药物,为临床个性化用药给出基因角度的建议。
一种鉴定甜瓜性别的引物和方法及其应用
本发明提供了一种鉴定甜瓜性别的引物和方法及其应用,属于分子生物学领域。本发明的目的是为了鉴定甜瓜性别的过程繁琐、准确率低和速度慢的技术问题。本发明提供了一种鉴定甜瓜性别的引物,利用本发明提供的鉴定甜瓜性别的方法对甜瓜的基因型进行检测,根据基因型判断甜瓜的性别。本发明基于甜瓜雌性花发育G/g基因序列设计高通量检测的分子标记,并应用于甜瓜雌性系或雄性系基因的转育,可以大大节约时间和人工成本,提高分子标记辅助选择的育种效率。
一种用于检测基因长片段拷贝数变异的方法
本发明公开了一种用于检测基因长片段拷贝数变异的新方法;包括以下步骤:(1)得到待测样本的人基因组DNA;(2)添加人工内标(competitor)进行多重PCR扩增反应;(3)进行虾碱性磷酸酶(SAP)反应;(4)延伸反应得到人基因组DNA的延伸产物和人工内标的延伸产物;(5)纯化脱盐;(6)MassARRAY飞行时间质谱;(7)根据FREQ数据,计算拷贝数变异系数(TR值),并判断基因片段的拷贝数;本发明适用于基因长片段拷贝数变异的检测,是一种新的检测基因长片段拷贝数变异的方法,具有大通量、准确性高、成本低等特点。
染色体平衡易位患者的囊胚发育潜能评估方法
本发明提供了一种基于线粒体DNA拷贝数的染色体平衡易位患者囊胚发育潜能评估方法,主要流程包括活检取囊胚中3-6个滋养外胚层细胞,采用MALBAC方法对活检细胞进行单细胞基因组扩增,扩增产物进行高通量DNA测序,测序量不低于20GB;通过测序数据分析囊胚的染色体整倍性和单位核基因组对应的线粒体DNA拷贝数即MCN,MCN=(常染色体映射区域×2×线粒体映射reads数)/(常染色体映射reads数×线粒体映射区域),在染色体整倍性囊胚中优先选择MCN低于320.5的囊胚进行移植。本发明方法有助于筛选出最具发育潜能的囊胚进行移植,使得行PGT的染色体平衡易位患者最大限度和最快实现妊娠,并且不增加患者的花费,还可以有效节约临床资源和成本。