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circTMEM165在制备诊断和/或治疗心血管疾病产品中的应用
本发明公开了一种circTMEM165在制备诊断和/或治疗心血管疾病产品中的应用;本发明中circTMEM165可以与下游靶基因miR-192-3p发挥结合作用,并对miR-192-3p的下游靶蛋白SCP2能够起到很好的修复由miR-192-3p引起的细胞损伤;使得circTMEM165通过circTMEM165/miR-192-3p/SCP2轴调控内皮细胞的炎症黏附、线粒体分裂以及内皮细胞凋亡作用;进而为动脉粥样硬化的预防、治疗及诊断提供新的靶点和思路。
一种用于预测儿童肥胖症的组合物及其应用
本发明提供了一种预测儿童肥胖症的组合物及相应的引物组。本发明根据产气夹馍菌(Clostridium)、拟杆菌(Bacteroides)、双歧杆菌(Bifidobacterium)以及乳酸杆菌(Lactobacillus)的16srDNA序列,设计能够扩增产气夹馍菌(Clostridium)、拟杆菌(Bacteroides)、双歧杆菌(Bifidobacterium)以及乳酸杆菌(Lactobacillus)的引物及探针。通过荧光定量PCR方法进一步测定粪便中产气夹馍菌(Clostridium)、拟杆菌(Bacteroides)、双歧杆菌(Bifidobacterium)以及乳酸杆菌(Lactobacillus)的含量,来判定儿童是否是患有肥胖症,肥胖儿童粪便中的乳酸杆菌以及产气夹馍菌明显高于正常儿童,而拟杆菌以及双歧杆菌的量明显低于正常儿童。本发明的方法具有较高的特异性及灵敏度,且操作简单,准确,适合推广应用。
一种鉴定甜瓜性别的引物和方法及其应用
本发明提供了一种鉴定甜瓜性别的引物和方法及其应用,属于分子生物学领域。本发明的目的是为了鉴定甜瓜性别的过程繁琐、准确率低和速度慢的技术问题。本发明提供了一种鉴定甜瓜性别的引物,利用本发明提供的鉴定甜瓜性别的方法对甜瓜的基因型进行检测,根据基因型判断甜瓜的性别。本发明基于甜瓜雌性花发育G/g基因序列设计高通量检测的分子标记,并应用于甜瓜雌性系或雄性系基因的转育,可以大大节约时间和人工成本,提高分子标记辅助选择的育种效率。
无酶且无扩增的测序
本发明涉及测序探针、方法、试剂盒和装置,其提供具有长读取长度和低误差率的无酶、无扩增和无文库的核酸测序。使用的序列探针包含靶结合域和条形码域;其中所述靶结合域包含至少四个核苷酸,且能够结合靶核酸;其中所述条形码域包含合成主链,所述条形码域包含至少第一附接区域,所述第一附接区域包含能够被第一互补核酸分子结合的核酸序列,且其中所述第一附接区域的所述核酸序列确定由所述靶结合域的第一个核苷酸结合的所述靶核酸的第一核苷酸的位置和身份。
基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法及应用
本发明涉及一种基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法及应用。所述微生物种群鉴定方法,通过对微生物的目标片段进行三核苷酸和单核苷酸循环的测序反应,得到测序图谱,根据测序图谱绘制比色带,通过分析比色带或/和测序图谱确定微生物种类;所述三核苷酸为dATPαS、dCTP、dTTP、dGTP中的任意三种核苷酸;所述单核苷酸为不包括早三核苷酸中的另一核苷酸。本发明微生物种群鉴定方法缩短了检测时间,且可通过分析比色带或/和检测图谱,得出检测结果,简化了数据分析过程。本发明微生物种群鉴定方法的应用还包括对定向突变位点的测序。
一种用于检测基因长片段拷贝数变异的方法
本发明公开了一种用于检测基因长片段拷贝数变异的新方法;包括以下步骤:(1)得到待测样本的人基因组DNA;(2)添加人工内标(competitor)进行多重PCR扩增反应;(3)进行虾碱性磷酸酶(SAP)反应;(4)延伸反应得到人基因组DNA的延伸产物和人工内标的延伸产物;(5)纯化脱盐;(6)MassARRAY飞行时间质谱;(7)根据FREQ数据,计算拷贝数变异系数(TR值),并判断基因片段的拷贝数;本发明适用于基因长片段拷贝数变异的检测,是一种新的检测基因长片段拷贝数变异的方法,具有大通量、准确性高、成本低等特点。
染色体平衡易位患者的囊胚发育潜能评估方法
本发明提供了一种基于线粒体DNA拷贝数的染色体平衡易位患者囊胚发育潜能评估方法,主要流程包括活检取囊胚中3-6个滋养外胚层细胞,采用MALBAC方法对活检细胞进行单细胞基因组扩增,扩增产物进行高通量DNA测序,测序量不低于20GB;通过测序数据分析囊胚的染色体整倍性和单位核基因组对应的线粒体DNA拷贝数即MCN,MCN=(常染色体映射区域×2×线粒体映射reads数)/(常染色体映射reads数×线粒体映射区域),在染色体整倍性囊胚中优先选择MCN低于320.5的囊胚进行移植。本发明方法有助于筛选出最具发育潜能的囊胚进行移植,使得行PGT的染色体平衡易位患者最大限度和最快实现妊娠,并且不增加患者的花费,还可以有效节约临床资源和成本。
一种检测SARS-CoV-2 RNA的探针组、ECL生物传感器及其制备方法和应用
本发明提供一种检测SARS-CoV-2RNA的系统,包括探针组和CRISPR/Cas12a系统和ECL生物传感器。在ZIF-8的表面链接了自增强的钌复合物,在不添加共反应物的情况下获得了高的分子内电子转移效率,从而获得了强而稳定的ECL信号。DSN参与的目标循环和CHA信号放大,既实现了信号的级联放大,又将不稳定的目标RNA转变成稳定的dsDNA进行输出。该策略中的dsDNA可以激活Cas12a的反式裂解特性,裂解与C-3N-4表现出亲和力的Fc标记的DNA探针。因此,目标RNA的浓度可以决定吸附在C-3N-4表面的Fc标记的DNA探针的数量,从而直接影响ECL强度。
基于特征序列设计引物的方法及系统
本发明公开了一种基于特征序列设计引物的方法,其步骤包括:将阳性序列和阴性序列进行整合;将阳性序列分割成适合进行比对的片段,并记录分割的位置;使用blast对阴性序列进行建库,然后将片段化的阳性序列比对到阴性序列进行筛选,得到一致性较低的特异性序列;使用primer3对特异性序列进行引物设计,得到上游引物、下游引物和探针的序列及位置;使用blast比对软件、阴性序列数据库、NCBI的nt数据库对得到的引物和探针进行再次筛选,并取引物和探针的交集;通过目录输出比对结果。并公开了基于特征序列设计引物的系统。本发明可以一步完成从基因组到目标序列和引物片段的引物设计。
一种宏基因组绝对定量的检测方法及其应用
本发明提供了一种宏基因组绝对定量的检测方法及其应用。所述检测方法中在待测样本DNA中加入微生物绝对定量用参照DNA,经过两轮扩增之后,使用测序平台测序和基因组序列比对,实现所述待检测样本中微生物含量的绝对定量。所述检测方法能够快速建立原核生物,真核生物和真菌检测体系,降低检测成本,且灵敏度较高,是一种准确、可靠的能对单位质量样本中的微生物的含量进行绝对定量方法。