本发明公开了一种空中交通管制系统威胁影响分析方法、系统及设备,包括构建机场-航路-扇区网络拓扑结构;确定约束条件及目标函数,并获取航班实际路径;利用系统正常运行延误和系统受到威胁后的延误,得到当前威胁影响对比结果;根据不同威胁影响对比结果,得到空中交通管制系统威胁影响分析结果;本发明通过构建机场-航路-扇区网络拓扑结构,能够同时或分别对机场网络、航路网络及扇区网络的外界威胁进行模拟;采用机场排队模型对地面延误的描述,采用航班实际路径对空中延误,实现对空中交通管制系统延误产生的真实体现,有效体现系统内部的相互作用;以系统运行延误为指标,实现对外界威胁的量化,直观体现威胁影响大小。