本发明公开了一种改造后的新冠病毒SARS-CoV-2S蛋白、及其构建的重组质粒和重组卡介苗及应用,属于生物制剂技术领域,本发明的改造新冠病毒S基因全序列,通过对基因启动子区域部分序列与终止子区域部分序列进行改造,使其能够在大肠杆菌-结核杆菌穿梭质粒pMV261中顺利表达,得到重组质粒pMVS;并通过电转化将重组质粒pMVS导入BCG,得到重组的BCG(rBCG);rBCG能够成功表达S蛋白,唤起人体免疫反应,诱导抗体产生来阻止病毒的侵入,构建的rBCG为亚单位疫苗,比亲代BCG更具有保护效果,既能预防或治疗新冠病毒又能预防或治疗结核杆菌,具有巨大的社会效益。