本发明公开了一种基于韧性城市的互相依赖的水电系统的功能恢复决策方法,包括:S1、初始化数据:S2、随机生成若干条损伤构件序号的序列,这些序列作为染色体即为初始种群,设置染色体切片的身份编码和相应损伤状态下水电整体功能水平的信息池,并设置遗传算法的迭代次数;S3、判断需评估的染色体切片的身份编码是否已经存在于信息池中:若存在,则直接调用信息池中的水电整体功能水平;否则,计算获取水电整体功能水平;S4、对染色体进行操作,获得下一代染色体,如已经达到迭代次数,则基于适应性函数值选取最优染色体。本发明在优化互相依赖的水电系统的功能恢复决策方法时,能满足灾后恢复的时间紧迫性要求,从而能真正应用到实际灾害场景中。