本发明属于针织面料技术领域,尤其为一种有机棉壳聚糖纤维混纺纱针织面料及其制备方法,包括面料本体,所述面料本体由有机棉纤维和壳聚糖纤维混纺纱针织而成,所述面料本体的表面上设有用于防护的防护层,所述防护层由内到外依次是抗菌层和耐磨层。本发明通过将壳聚糖纤维与有机棉纤维混纺纱针织,使面料具有良好的抗菌性能,抗菌率非常高,90%以上的常见细菌在壳聚糖纤维上不能存活,且吸湿透气性良好,更加亲肤,对皮肤不会产生刺激,适合做婴幼儿服装及男女高档内衣,通过抗菌层能够进一步提高本面料的抗菌性能,避免细菌的滋生,通过耐磨层显著提高了面料的拉伸强力、撕破强力、耐磨性能,增强了面料的穿着舒适性和使用寿命。