本发明公开了一种微生物发酵罐内部搅拌机制,包括罐体,罐体内设有搅拌腔以及环境调节腔,搅拌腔外壁上设有第一接种物添加部件,罐体底部设有第二接种物添加部件;罐体内设有循环搅拌装置,循环搅拌装置包括设于罐体顶部的升降部件,设于升降部件执行端的驱动电机,设于驱动电机执行端的搅拌轴管,设于隔板底部的导料部件、顶部的刮料部件,以及设于环境调节腔底部的回流部件;环境调节腔外壁上设有湿度调节部件以及含氧量调节部件,湿度调节部件检查端延伸至环境调节腔内,含氧量调节部件执行端套设于导料部件外部。本发明是一种便于在搅拌时对底物的含氧量及含水量进行控制的,便于底物与接种物间多次接触混合的搅拌机制。