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分子相似性搜索
一种用于查找与查询分子相似的分子的系统,包括:GCN、PFS向量提取器、经补偿的向量比较器(CVC)以及候选向量选择器。GCN已经被训练以分别根据输入查询分子向量或输入候选分子向量输出分子属性向量。GCN将查询原子特征集(AFS)向量和候选AFS向量转换为查询属性特征集(PFS)嵌入向量和候选PFS嵌入向量。PFS向量提取器从经训练的GCN的隐藏层中提取查询PFS嵌入向量和候选PFS嵌入向量。经补偿的向量比较器(CVC)针对至少一对查询PFS嵌入向量和一个候选PFS嵌入向量,计算经补偿的相似性度量(CSM)。候选向量选择器仅选择这种候选分子向量。
一种用于硼表化学滴定的人机交互方法及装置
本发明公开了一种用于硼表化学滴定的人机交互方法及装置,该方法通过获取主机发送的溶液配置指令,并根据溶液配置指令携带的配置硼浓度组别代码和当前标定点标识进行溶液配置,当溶液配置完成则生成溶液配置完成标识并发送给主机,以使主机基于溶液配置完成标识发送取样滴定指令,基于取样滴定指令进行溶液取样和化学滴定,当溶液取样完成且化学滴定完成,则生成取样滴定结束指令,并发送滴定硼浓度数值给主机,提高操作准确性和硼表校准效率。
一种近α型钛合金航空模锻件微观组织变化的预测方法
本发明提供一种近α型钛合金航空模锻件微观组织变化的预测方法,其包括以下步骤:S1、材料在不同工艺条件下的微观组织测定;S2、通过统计分析不同处理工艺下试件心部的微观组织,特别是初生α相的含量变化;S3、建立初生α相变化的预测模型;S4、模锻试验;S5、基于初生α相变化的预测模型,通过有限元数值模拟分析,实现近α钛合金模锻件微观组织变化的可视化预测。本发明建立的一种近α型钛合金航空模锻件微观组织变化的预测方法,可以有效的预测近α钛合金坯料在高温模锻后的初生α相的分布规律及因动态相变所消耗的初生α相的含量,实现微观组织中初生α相变化的可视化预测。
一种基于图像卷积的分子特征提取及性能预测方法
本发明提供了一种基于图像卷积的分子特征提取及性能预测方法,通过对原子及原子之间化学键的信息进行量化,构成分子图像的节点特征矩阵,进而抽取分子中各原子之间的连接信息,构成图像的邻接矩阵,将特征矩阵和邻接矩阵融入基于图像卷积的网络模型中获得包含比较完全的原子信息、化学键信息以及分子结构信息的分子的特征矩阵,再进行模型训练,得到最终的网络模型。本发明实现了分子信息的有效抓取,提升了模型分子性能的预测精度。
基于图神经网络的miRNA-疾病关联关系预测方法
本发明提出了一种基于图神经网络预测miRNA-疾病关联关系方法,实现步骤为:获取miRNA-疾病关联数据;构建miRNA-疾病关联网络;获取样本数据集和标签数据集;提取每个miRNA-疾病节点对的h阶封闭子图;获取每个h阶封闭子图的节点特征矩阵;获取训练样本集,训练样本标签数据集和被预测样本集;搭建图神经网络;对图神经网络进行迭代训练;获取miRNA-疾病关联的预测结果。本发明利用图神经网络从miRNA-疾病关联网络中学习图结构特征信息用于解决现有技术预测准确率较低的问题,在不使用相似性数据的情况下提高了miRNA-疾病关联预测准确率,可用于预测潜在的miRNA-疾病关联。
DNA6mA修饰类别的预测方法、装置、设备和存储介质
本申请提供了一种DNA6mA修饰类别的预测方法、装置、设备和存储介质。方法包括:获取DNA6mA特征数据集;确定所述DNA6mA特征数据集中各个序列间的相似度矩阵;对所述相似度矩阵进行对数化处理,获得所述各个序列间的第一矩阵;对所述距离矩阵进行高斯化处理,获得满足正定性要求的距离矩阵;将所述满足正定性要求的距离矩阵作为支持向量机的自定义核矩阵,并基于支持向量机模型,对待预测序列的DNA6mA修饰类别进行预测。能够预测序列的DNA6mA修饰类别。
一种基于二代测序数据的HLA分型方法
本发明公开了一种基于二代测序数据的HLA分型方法,本方法首先构建HLA参考序列数据库,然后进行二代测序数据分析。二代测序数据分析包括原始HLA数据质控与过滤、HLA参考序列进行序列比对、统计比对结果、重构HLA参考序列、进行二次比对和统计比对结果。二代测序数据分析后利用聚类算法与HLA序列特征判断序列杂合位置;根据杂合位置进行局部重比对,分离出单倍型序列;根据单倍型序列遍历HLA数据库,匹配出最佳HLA型别。本发明的分型方法可准确获得HLA型别结果,整体准确率在99%以上,大大提高了HLA二代测序数据的分析效率。
一种sgRNA的靶标活性预测方法、装置、设备和存储介质
本申请提供了一种sgRNA的靶标活性预测方法、装置、设备和存储介质。方法包括:获取sgRNA序列数据集;对所述sgRNA序列数据集进行序列特征提取,得到多个特征信息;将所述多个特征信息进行融合,得到特征集;基于所述特征集对种子模型进行训练,得到活性预测模型;获取待预测sgRNA序列;基于所述活性预测模型,预测所述待预测sgRNA序列的靶标活性。能够确定sgRNA的靶标活性。
一种肿瘤微环境及肿瘤基因突变检测系统、方法及设备
本发明属于医学图像领域,具体涉及了一种肿瘤微环境及肿瘤基因突变检测方法、系统及设备。本发明系统包括图像扫描装置和上位机,上位机包括数据处理模块、肿瘤微环境检测模块和肿瘤基因突变检测模块,图像扫描装置拍摄离体肿瘤样本的全景扫描图像;对全景扫描图像进行预处理得到第一训练图集;将第一训练图集输入至预构建的生物标志物分布预测训练模型中进行迭代训练,得到生物标志物分布预测图集;肿瘤基因突变检测模块根据生物标志物分布预测图集确定第二训练图集;将第二训练图集输入到基因突变检测模型进行基因突变检测。本发明降低了实验成本,缩短了实验周期,并且降低了判读结果的主观性。
一种无细胞翻译体系、方法及产物
本文涉及技术属于分子生物学领域,尤其涉及一种无细胞翻译体系、方法及产物。所述翻译体系包括:5’帽子及3’多聚腺苷酸的mRNA、氨基酸混合物、能量分子、mRNA翻译酶源的混合物;所述能量分子包括磷酸肌酸、ATP和鸟苷三磷酸(GTP)。所述翻译体系经过mRNA转录、体外转录和凝胶电泳分析确定可以迅速获得大量目的蛋白并具有以下特点:采用细胞外翻译技术克服了原核细胞表达部分基因不能表达问题;采用细胞外翻译技术克服了真核细胞表达周期长效率低问题;采用添加磷酸肌酸等能量小分子的策略优化了原有细胞外翻译技术的活性低、效率差问题;采用5’帽子及3’多聚腺苷酸的mRNA增强稳定性和与受体结合速度及整体翻译速度。