本发明公开了一种香水莲花多糖提取物及其制备方法和应用。取香水莲花粉碎,加水浸提,提取液经浓缩获得浸膏;向浸膏中加入乙醇溶液,搅拌后过滤,沉淀冷冻干燥后,得多糖粗提物I;取多糖粗提取物I溶于水中,用Sevag法脱蛋白,沉淀洗出后过滤,沉淀经过干燥后,得多糖粗提物II;除单糖及寡糖:将多糖粗提物II溶于水中,使用8000-14000D截止分子量的透析膜进行透析,向透析后的多糖粗提物液体加入乙醇溶液,搅拌至沉淀吸出后过滤,沉淀干燥后得多糖粗提物III;凝胶柱纯化:将多糖粗提物III用凝胶色谱柱纯化,用硫酸-苯酚法跟踪馏分,收集主峰合并后,加入乙醇溶液,搅拌后过滤,沉淀冷冻干燥,得香水莲花多糖提取物。其具有抗菌、美白、保湿、抗氧化的作用。