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分子相似性搜索
一种用于查找与查询分子相似的分子的系统,包括:GCN、PFS向量提取器、经补偿的向量比较器(CVC)以及候选向量选择器。GCN已经被训练以分别根据输入查询分子向量或输入候选分子向量输出分子属性向量。GCN将查询原子特征集(AFS)向量和候选AFS向量转换为查询属性特征集(PFS)嵌入向量和候选PFS嵌入向量。PFS向量提取器从经训练的GCN的隐藏层中提取查询PFS嵌入向量和候选PFS嵌入向量。经补偿的向量比较器(CVC)针对至少一对查询PFS嵌入向量和一个候选PFS嵌入向量,计算经补偿的相似性度量(CSM)。候选向量选择器仅选择这种候选分子向量。