本发明要求保护一种强化型微生物发酵制备硫酸庆大霉素及其应用方法,该强化型微生物工程菌为经常压室温等离子诱变技术筛选获得的一株绛红色小单孢菌(Micromonospora purpurea)C2 1591菌株,已于2021年6月13日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心登记保藏(其简称CGMCC,地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号),保藏编号为CGMCC No.59450。本发明筛选得到的定向高产庆大霉素C2的工程菌可以定向高产庆大霉素C2,庆大霉素C2的组份比由原来的15%左右提高到现在的85%以上,而且通过Plackett-Burman设计实现了优化后的配方的发酵效价最高为1184U/mL,比原配方的效价提高了42%。经与出发菌株相比,庆大霉素C2产量提高了3倍,而且基本不含有其他的同型异构体或者杂质,可以直接进行下游应用,不需要再进行复杂的生物转化和提纯,节省了大量的成本,满足产业化要求。