本发明公开了一种微生物电芬顿耦合过硫酸钠降解全氟辛酸的方法,包括如下步骤:制作微生物电芬顿系统所需的阳极碳刷,并预处理;为培养产电微生物,配制微生物生长所需营养液;在反应器阳极室加入厌氧污泥和营养液,并通入氮气,阴极室为铁氰化钾溶液,对产电微生物进行培养与驯化;将阳极产电菌培养完成的反应器阴极溶液替换成全氟辛酸溶液,并加入过硫酸钠,施加电压,得到电芬顿耦合过硫酸钠降解全氟辛酸反应器;将反应器维持在维持适宜的温度,向阴极室中通入空气,在有氧条件下全氟辛酸降解。该方法中使用产电微生物做阳极的电芬顿系统能够在较低电压下产生过氧化氢;该方法中羟基自由基和过硫酸钠相互配合,能够加快全氟辛酸的降解速度。