本发明提供了一种客滚船低温冷却水温度控制系统,包括多个冷却海水泵、中央冷却器、三通温控阀、多个低温冷却淡水泵、自动化控制系统、三通温控阀远程控制板以及两个三通温控阀就地控制箱,两个所述三通温控阀就地控制箱分别设有客滚船的左机舱和右机舱,所述三通温控阀就地控制箱设于机舱内,三通温控阀就地控制箱与三通温控阀电性控制连接,在所述三通温控阀与低温冷却淡水泵之间的管路上设有第三温度传感器,第三温度传感器与三通温控阀就地控制箱电性连接。本发明的低温冷却水温度控制系统,满足了客滚船在安全返港工况下的低温冷却淡水的水温控制,实现变频泵与温控阀的协同控制,避免逻辑混乱,达至节能降耗的目的。