本发明公开了一种可适配多种显微镜的三轴自动载物台,包括固定板、可拆卸连接于固定板上的安装座、设于安装座上的Y轴机构、设于Y轴机构输出端上的X轴机构、设于X轴机构输出端上的Z轴机构以及设于Z轴机构输出端上的载物台,显微镜可拆卸连接于固定板上。本发明通过调节显微镜和载物台的相对安装位置以适应不同品牌、不同型号的显微镜,驱动X轴机构和/或Y轴机构和/或Z轴机构,带动载物台上的被检测物品以实现位置的移动和焦距的调节,配合显微镜不同倍数的镜头和摄像头,对载物台上的被检测物品进行自动观察、拍照和分析等,解决了对不同显微镜需单独改装载物台、Z轴不方便的问题,提高了实用性。