本发明公开了一种高真空原位原子力显微镜送样装置,包括底座,所述底座上安装有原子力显微镜本体:所述底座上对称开设有两个平行的开槽,其中一个所述开槽内设置有光杆,且光杆与开槽的内壁固定连接,另一个所述开槽内设置有螺杆,且螺杆与开槽的内壁转动连接,所述螺杆延伸至开槽外侧并连接有驱动其转动的驱动机构。本发明通过设置转轴,并设置配合转轴运动的翻转机构,通过主动拨盘带动从动槽轮将连续运动转化为间隙运动,从而实现转轴间隙转动。槽轮可以带动样品放置器皿同步翻转,可以实现上侧的样品放置器皿用于测量,两侧的样品放置器皿用于备选,便于实现切换测量,极大的节约了测量人员的时间和精力。