本发明公开了一种自动荧光检测设备,包括下机体、上机体和PC机,所述下机体的底部设置有底座,且下机体的上端安装有上机体,所述上机体上安装有PC机,且PC机的后部设置有后罩壳,所述顶板的中部安装有显微镜,且显微镜的下部前端设置有活动板,并且显微镜的下部后端设置有后固定板,所述活动板的下部安装有物镜,且物镜的下端朝向移动平台上,并且移动平台位于底座的上端面中部。该自动荧光检测设备,结构设置合理,方便进行显微预览和拍照,进行全自动样品扫描,数据信息既可以本地存储,也可以导出到外部设备上,使用更加灵活智能化,解放检测工作人员的双手,提高整体荧光检测效率,使用更加快速和自动化。