单细胞dna损伤的快速检测方法及试剂盒

文档序号:5883 发布日期:2021-09-17 浏览:47次 英文

单细胞DNA损伤的快速检测方法及试剂盒

技术领域

本发明属于生物检测

技术领域

,具体涉及一种单细胞DNA损伤的快速检测方法以及试剂盒。

背景技术

随着中国经济的加速发展,环境污染也日趋严重。目前,全球范围内的环境污染对人体健康也受到越来越多的关注。其中,环境污染物造成DNA的损伤会影响细胞的遗传稳定性,并可能对后代产生影响,引起孕妇流产、死胎、畸胎和某些遗传性疾病等。由于细胞的DNA损伤会造成疾病,威胁人类健康,因此对细胞DNA损伤进行检测,并了解这一损伤能否引起细胞事件的变化就显得十分重要。

自从碱性彗星实验问世以来,各相关实验室已将该技术广泛应用于检测细胞DNA的损伤,与此同时,也在不断的对该方法进行改良,使之能够检测细胞内不同的DNA损伤,例如单双链的断裂、碱基的氧化损伤、DNA-DNA/DNA-蛋白质-药物交联以及修复等。

该方法将单个细胞悬浮于琼脂糖凝胶中,经裂解处理后在电场中进行短时间的电泳,再用荧光染料染色。DNA受损细胞中形成DNA降解片段,在电场中泳动速度较快,使细胞核呈现出一种彗星式的图案,而正常的无DNA断裂的核在泳动时保持圆球形,是一种非常简便的检测细胞损伤的方式。

当前操作中,一般的单细胞DNA损伤的检测,采用一层凝胶,在电泳的过程中,该层凝胶太薄易脱落。若直接将凝胶层加厚,既容易因胶层过厚不易观察,又无法使细胞尽可能的处于同一个平面;若采用多层凝胶叠加的方式,两层胶面之间无法很好附着,脱胶现象依然存在。此外,当前所用细胞裂解液,含有用来破坏细胞膜的磷脂双分子层的肌氨酸钠,该物质在水中溶解度较低,导致裂解液配置时一直存在溶解性不佳的问题。

发明内容

本发明是为解决上述技术问题进行的,对当前的单细胞DNA损伤检测体系进行改进,提供了一种单细胞DNA损伤的快速检测方法及试剂盒,解决胶易脱落以及溶液配置困难的问题。

本发明的第一方面,提供了一种单细胞DNA损伤的快速检测方法,包括如下步骤:

A、铺胶

铺第一层胶,将电泳载玻片置于75%乙醇溶液中浸泡1~2h后擦干;铺胶前将载玻片在火焰上烤一遍,在受炙面的一端滴加普通琼脂糖凝胶0.1~0.3mL,用涂布棒水平铺拉凝胶到另一端,然后烤干,备用。

具体操作上,载玻片选择光面载玻片,尺寸为25mm×50mm×2mm;铺胶前,先将普通熔点的琼脂糖凝胶在75℃水浴锅中预热;铺胶后,采用涂布棒将普通琼脂糖凝胶涂匀后,采用酒精灯外焰烤干,烤干后能够长期保存,即用即取,直接进行第二层铺胶即可。

铺第二层胶:取30~50μL细胞悬液与150~250μL 1%低熔点琼脂糖凝胶吹打混匀,再取混合液滴在铺有底胶载玻片的一侧,用盖玻片从有胶的一侧缓缓放下,而后移去盖玻片。

具体操作上,该1%低熔点琼脂糖的配制方法如下:称量低熔点琼脂糖,加入体积为琼脂糖质量100倍的PBS溶液,置于37℃水浴锅中溶解。

细胞悬液与1%低熔点琼脂糖凝胶混匀后,混合液分五滴滴在铺有底胶载玻片的一侧,盖玻片盖上后,载波片系统被置于4℃条件下10~12min后,用水平推移的方法移去盖玻片。

B、裂解、解旋

使用表面滴加的方式,向步骤A中铺好细胞的载玻片上滴加裂解液100~500μL,用无菌水漂洗3次,将载玻片并列置于水平电泳槽内,电泳槽放于4℃,加入电泳缓冲液没过载玻片,浸泡20min,使DNA双链解螺旋,

细胞裂解液的配制方法如下:称量Tris 0.12~0.15g、NaOH 0.8~1.0g、NaCl14.5~15.0g、Na2EDTA3.72~4.0g置于烧杯中,加入80mL去离子水并用玻璃棒搅拌均匀使其完全溶解,调pH至10后定容至100ml,存放于4℃条件待用,用前加入曲拉通100和二甲基亚砜,终浓度均为1%。

发明人通过实验,配置细胞裂解液时,省去常用来破坏细胞膜的磷脂双分子层的肌氨酸钠,既保持了裂解液对细胞膜的破坏,又解决了配裂解液时不好溶解的问题。

C、电泳、染色及分析

在4℃、260~320mA恒定电流情况下进行碱式电泳,电泳结束后,依次采用中和缓冲液以及双蒸水进行中和及浸泡,而后进行染色和荧光拍片分析。

其中,碱性电泳缓冲液的配置方法如下:称量Na2EDTA 0.37~0.5g、NaOH12.0~15.0g置于烧杯中,加入800mL去离子水并用玻璃棒搅拌均匀使其完全溶解,调pH至13后定容至1L,存放于4℃。

中和缓冲液的配置方法如下:称量Na2EDTA4.85~5.0g置于烧杯中,加入80mL去离子水并用玻璃棒搅拌均匀使其完全溶解,调pH至7.5后定容至100mL,现配现用。

电泳时,电泳槽中的电泳缓冲液的液面比载玻片高出1~2cm;电泳结束后,用中和缓冲液中和3次,每次5min,接下来用双蒸水浸泡3次每次10min。载玻片用无菌水浸泡三次后,用滤纸吸干玻片上的液体后放在37℃恒温箱中烘干,能够不受时间的限制,随时拿出来染色采集荧光图片。

进行染色和荧光拍片分析的步骤如下:暗环境中,取稀释好的碘化丙啶染液10~20μL滴在烘干的载玻片上,以避免任何气泡产生的方式盖上盖玻片染色30min;将载玻片编为盲片,置于荧光显微镜下,选用×20倍物镜,每张片子随机拍照10~20个视野,计数拖尾细胞以及细胞拖尾率;再选择接近于视野中心、染色清晰、拖尾形态在目标样品中占优势的60~80个左右拖尾细胞,通过SCGE图像分析系统CASP测量并计算尾长、尾/头、尾/头%DNA以及尾距。

碘化丙啶染液的配制方法如下:称量碘化丙啶试剂20~25mg于棕色试剂瓶中,加入10~50mL pH7.4的PBS溶液置于涡旋振动器上充分震荡混匀后配置成2mg/ml的溶液,于4℃保存待用;碘化丙啶工作液为用PBS溶液稀释40倍使用。

本发明的第二方面,提供了一种单细胞DNA损伤的快速检测试剂盒,内含涂覆有底胶的载玻片、盖玻片、低熔点琼脂糖凝胶、曲拉通100、二甲基亚砜、NaCl、Na2EDTA、NaOH、PBS溶液、Tris、碘化丙啶试剂。进行单细胞DNA损伤时,从中选取所需的试剂进行溶液配置。

发明技术效果

首先,铺胶时,采用两层胶法,铺第一层时,铺胶前将载玻片在火焰上烤一遍,在受炙面的一端滴加普通琼脂糖凝胶,用涂布棒水平铺拉凝胶到另一端,然后烤干、备用,而后按照正常步骤进行第二层铺胶。两层胶法既能使胶面很好的附着,又能使细胞尽可能的处于同一个平面,效果较好,同时第一层胶烤干后,可能够长期保存,即用即取,直接进行第二层铺胶即可,简单便易。

其次,本发明配置细胞裂解液时,省去了常用来破坏细胞膜的磷脂双分子层的肌氨酸钠,既依旧保持了裂解液对细胞膜的破坏,又解决了配裂解液时不好溶解的问题。

第三,本发明经电泳和中和操作后处理后的载玻片可以即用即取,彗星电泳后的载玻片长期保存,随时拿出来染色采集荧光图片。

因此,本发明提供了一种检测单细胞DNA损伤的更加简便的方法,解决了检测过程中易脱胶,不易观察,不易操作等问题,使检测更易操作,且使操作更加灵活,方便,随取随测。

附图说明

图1是采用本发明方法进行HepG2细胞单细胞DNA损伤的彗星实验检测结果:(A)为不同药物剂量处理后细胞的彗星图像,(B)为不同药物剂量处理条件下,细胞的彗星阳性比例。

图2为CASP软件分析过程。

具体实施方式

为了更清楚地说明本发明,下面结合优选实施例对本发明做进一步的说明。本领域技术人员应当理解,下面所具体描述的内容是说明性的而非限制性的,不应以此限制本发明的保护范围。

实施例一单细胞DNA损伤的快速检测方法

1、铺胶

制胶前准备:操作前半小时打开75℃和37℃的水浴锅。

第一层胶:第一层胶即底胶,选择光面的载玻片,先将所有的载玻片洗净放在酒精中浸泡1h后用擦镜纸擦干;点上酒精灯,铺胶前将载玻片在火焰上烤一遍,在受炙面的一端滴加在75℃水浴锅中预热的普通熔点的琼脂糖凝胶0.1~0.3mL,马上用三角玻璃棒水平铺拉凝胶到另一端,进而用酒精灯外焰烤干,备用。

第二层胶:取30~50μL细胞悬液与150~250μL 1%低熔点琼脂糖凝胶吹打混匀,再取混合液分5滴滴在铺有底胶载玻片的一侧,然后用盖玻片从有胶的一侧缓缓放下,不要有气泡产生,而后置于4℃环境中,10-12min后,用水平推移的方法移去盖玻片。

2、裂解、解旋

配制细胞裂解液:称量Tris 0.12~0.15g、NaOH 0.8~1.0g、NaCl 14.5~15.0g、Na2EDTA3.72~4.0g置于烧杯中,加入80mL去离子水并用玻璃棒搅拌均匀使其完全溶解,调pH至10后定容至100ml,存放于4℃条件待用,用前加入曲拉通100和二甲基亚砜,终浓度均为1%。

将铺好细胞的载玻片,使用表面滴加的方式,滴加裂解液100~500μL,用无菌水漂洗3次,将载玻片并列置于水平电泳槽内,电泳槽放于4℃,加入电泳缓冲液没过载玻片,浸泡20min,使DNA双链解螺旋。

3、电泳、中和

在4℃、260~320mA条件下电泳10min。电泳后,用中和缓冲液中和3次,每次5min,再用无菌水浸泡3次每次10min。用滤纸吸干玻片上的液体后放在37℃恒温箱中烘干。烘干后,能够不受时间的限制,随时拿出来染色采集荧光图片。

碱性电泳缓冲液的配置方法如下:称量Na2EDTA0.37~0.5g、NaOH 12.0~15.0g置于烧杯中,加入800mL去离子水并用玻璃棒搅拌均匀使其完全溶解,调pH至13后定容至1L,存放于4℃。

中和缓冲液的配置方法如下:称量Na2EDTA4.85~5.0g置于烧杯中,加入80mL去离子水并用玻璃棒搅拌均匀使其完全溶解,调pH至7.5后定容至100mL,现配现用。

4.染色、荧光拍片分析

取稀释好的PI染液10~20μL滴在烘干的载玻片上,盖上盖玻片(避免任何气泡)染色30min。以上各步骤均在暗环境中操作,避免光对DNA的额外损伤。每个剂量组做3次重复。将载玻片编为盲片,置于荧光显微镜下(物镜×20倍),每张片子随机拍照10~20个视野(视细胞多少而定),计数拖尾细胞,计算细胞拖尾率(形状指标),拖尾率=(拖尾细胞数/观察细胞数)×100%。再选择接近于视野中心、染色清晰、拖尾形态在目标样品中占优势的60~80个左右拖尾细胞,通过SCGE图像分析系统CASP测量并计算尾长、尾/头(长)、尾/头%DNA、尾距等较为客观的距离指标和复合指标。

实施例二验证实验

1、实验细胞

选择HepG2细胞作为实验对象。

2、供试细胞准备及损伤处理

取对数生长期的细胞制成细胞悬液,细胞经离心去掉胰酶与培养基后用新鲜培养基重新悬浮以供使用;调整细胞密度至1×105~1×106cells/ml(通过细胞计数仪进行技术),接种于6孔细胞培养板后,待24h后光镜检测细胞确认其贴壁生长正常,弃去孔中培养基,准备药物染毒细胞后继续培养。

将药物的母液用HepG2细胞培养基稀释为对应浓度(5μM、10μM、20μM、40μM)的供试药液后,在准备好的细胞培养板中每孔加入2ml供试药液置于相应的培养箱中静置培养相应的时间。对照组以0.1%二甲亚砜为空白对照组,各组试验独立重复三次。

3、结果分析

采用实施例一中的方法进行检测,电泳过程中没有出现脱胶的情况。HepG2细胞染毒不同剂量的药物后,经过彗星实验、图像采集,然后用CASP软件分析。

随着药液浓度的增加,“彗星”尾矩逐渐延长(图1A),细胞的彗星阳性比例也随着药液浓度的增加而增加(图1B),说明细胞的DNA损伤程度与药液浓度呈正相关。本发明的细胞裂解液完全能够实现细胞裂解,不会对后续电泳和染色造成任何影响。

CASP软件分析的大体过程如图2所示。各实验材料的每个梯度在平行的实验条件下,重复三次,每个重复玻片取100-150个细胞,图像输入软件中分析记录数据。各细胞DNA彗星的头长度、尾部长度,头部DNA含量、尾部DNA含量、TM值、以及OTM即可由软件自动生成,其中的尾部长度,头部DNA含量、TM值是用以分析细胞DNA损伤的指标。

以上显示和描述了本发明的基本原理、主要特征和本发明的优点。本行业的技术人员应该了解,本发明不受上述实施例的限制,上述实施例和说明书中描述的只是说明本发明的原理,在不脱离本发明精神和范围的前提下本发明还会有各种变化和改进,这些变化和改进都落入要求保护的本发明范围内。本发明要求保护范围由所附的权利要求书及其等同物界定。

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