一种醛醇氧化酶二聚体及其制备方法
技术领域
本发明涉及蛋白质工程与酶工程领域,尤其涉及一种酶活提高的醛醇氧化酶二聚体及其制备方法。
背景技术
醛醇氧化酶(alditol oxidase,EC 1.1.3.41,AldO)为一种可溶性单体黄素依赖型氧化酶。它的主要功能是催化多种醛糖醇的末端伯羟基进行选择性氧化获得醛或酸,因此醛醇氧化酶可用于生产多元醇酸。醛醇氧化酶在生物催化转化甘油的工业领域具有巨大应用前景,AldO可直接转化甘油得到高附加价值甘油酸,甘油酸作为新型的酸化剂和医药中间体具有重要的应用价值。
现有的醛醇氧化酶其最适底物为木糖醇和山梨醇,但是对甘油的氧化能力相对比明显偏弱。研究醛醇氧化酶的催化氧化醛糖醇类底物的氧化机制一直是一个热门的话题。目前,已经有部分关于提高醛醇氧化酶对甘油催化活力的报道,但是大多集中在活性口袋部分的定点突变,能显著改善对甘油的酶活的方法报道较少。如Gerstenbruch等在《Asymmetric synthesis of d-glyceric acid by an alditol oxidase and directedevolution for enhanced oxidative activity towards glycerol》研究报道中将Streptomyces coelicolor A3(2)来源的醛醇氧化酶利用定向进化的方式,得到一株四突变株,相较于野生型醛醇氧化酶其对甘油的酶活力由0.185U/mg提升至0.624U/mg,但仍处于较低水平。
发明内容
针对现有技术的不足,本发明的目的是提供一种醛醇氧化酶二聚体及其制备方法,所述醛醇氧化酶二聚体对甘油的氧化能力有显著的提高,且对其它糖醇类底物的催化效率普遍提升了10~24倍。
一种醛醇氧化酶二聚体,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
一种醛醇氧化酶二聚体的制备方法,其制备步骤包括:
(1)将SpyTag/SpyCatcher基因与p53dim基因融合后与载体连接,得到重组质粒pETDuet-TXC,所述酿脓链球菌Streptococcuspyogenes来源的SpyTag/SpyCatcher的核苷酸序列如SEQ ID NO.4,所述肿瘤抑制因子来源的p53二聚结构域的核苷酸序列如SEQ IDNO.3;
(2)以质粒pETDuet-AldO为模板,其核苷酸序列为SEQ ID NO.2,用P1和P2为引物扩增得到含AldO的目的基因片段,
P1核苷酸序列为:GAGCTCATGAGCGACATCACCGTTAC;
P2核苷酸序列为:GTCGACAGAACCTGAGCCTGAGCCCGCCAGCACACCGCGC;
(3)以质粒pETDuet-TXC为模板,通过酶切连接将目的片段AldO连接至质粒pETDuet-TXC上,得到重组质粒pETDuet-TXAC;
(4)重组质粒pETDuet-TXAC转化到大肠杆菌JM109,经菌落PCR筛选阳性转化子筛选后,获得基因工程菌pETDuet-TXAC JM109,再将重组质粒pETDuet-TXAC转化E.coli BL21(DE3),得到基因工程菌pETDuet-TXAC BL21(DE);
(5)将基因工程菌pETDuet-TXAC BL21(DE)接种于TB液体培养基中,37℃,200-220rpm培养12-16h;按1-2%的接种量转接到TB培养基中,先于30℃、200-220rpm,培养3-5h直至600nm处的光密度值达到0.4至0.8时,加入终浓度为1mM异丙基β-D-1-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)进行诱导,16-18℃、200-220rpm,培养20-24h;
(6)发酵液于10000rpm,4℃条件下离心10min,收集沉淀,用重悬液重悬菌体,重悬液组成:20mM Na2HPO4、20mM咪唑、500mM NaCl、1mM DTT、0.5mM PMSF,pH 7.4,后经超声破碎后离心,上清即为醛醇氧化酶二聚体的粗酶液,采用Ni-NTA亲和层析以及SEC两步纯化得到醛醇氧化酶二聚体catAldO。
本发明的另一目的是提供一种表达醛醇氧化酶二聚体的基因工程菌的构建方法,构建步骤包括:
(1)将SpyTag/SpyCatcher基因与p53dim基因融合后与载体连接,得到重组质粒pETDuet-TXC,所述酿脓链球菌Streptococcuspyogenes来源的SpyTag/SpyCatcher的核苷酸序列如SEQ ID NO.4,所述肿瘤抑制因子来源的p53二聚结构域的核苷酸序列如SEQ IDNO.3;
(2)以质粒pETDuet-AldO为模板,其核苷酸序列为SEQ ID NO.2,用P1和P2为引物扩增得到含AldO的目的基因片段,
P1核苷酸序列为:GAGCTCATGAGCGACATCACCGTTAC;
P2核苷酸序列为:GTCGACAGAACCTGAGCCTGAGCCCGCCAGCACACCGCGC;
(3)以质粒pETDuet-TXC为模板,通过酶切连接将目的片段AldO连接至质粒pETDuet-TXC上,得到重组质粒pETDuet-TXAC;
(4)重组质粒pETDuet-TXAC转化到大肠杆菌JM109,经菌落PCR筛选阳性转化子筛选后,获得基因工程菌pETDuet-TXAC JM109,再将重组质粒pETDuet-TXAC转化E.coli BL21(DE3),得到一种表达醛醇氧化酶二聚体的基因工程菌pETDuet-TXAC BL21(DE)。
本发明的有益效果:
本发明采用蛋白质工程构建醛醇氧化酶二聚体的方法,将醛醇氧化酶不同功能结构域的空间距离拉近,不仅显著提高了醛醇氧化酶对甘油的氧化能力,而且使该酶对其它糖醇类底物的催化效率普遍提升了10~24倍。本发明使用的醛醇氧化酶基因来源于天蓝色链霉菌Streptomyces coelicolorA3(2),pH适应范围广,稳定性高(pH适应范围6-9,最适反应pH范围为7-8,最适反应温度为55℃)。
附图说明
图1为本发明实施例catAldO蛋白的SDS-PAGE电泳图,M:Marker;泳道1:粗酶液;泳道2:经Ni-NTA纯化样品;泳道3:经SEC纯化catAldO。
图2为本发明实施例catAldO催化甘油(A)、D-山梨糖醇(B)、D-甘露醇(C)、阿拉伯糖(D)和1,2-丙二醇(E)的反应动力学曲线。
具体实施方式
下面通过实施例对本发明进行具体的描述,有必要在此指出的是以下实施例只用于本发明的进一步说明,不能理解为对本发明保护范围的限制,任何与所记载内容相似或均等的方法及材料皆可用于本发明中。
本申请实施例中使用的培养基西方如下:
LB培养基:酵母膏5g/L,胰蛋白胨10g/L,NaCl 10g/L。
TB培养基:24g酵母膏,12g蛋白胨,4g甘油加入蒸馏水溶解并定容至900mL为A液。称取12.54g K2HPO4和2.31g KH2PO4加入蒸馏水溶解并定容至100mL为B液。二者单独高温灭菌处理,冷却至室温后,于无菌工作台将A液与B液混合即得。
固体培养基则是在液体培养基中加2%的琼脂。
实施例1:重组质粒构建
(1)根据NCBI上登录号为4MLS_B的SpyTag基因序列、登录号为AFD50637.1的SpyCatcher基因序列以及p53dim基因串联送至公司全合成,构建质粒pETDuet-TXC。所述酿脓链球菌Streptococcuspyogenes菌来源的SpyTagSpyCatcher的核苷酸序列如SEQ IDNO.4,所述肿瘤抑制因子来源的p53二聚结构域的核苷酸序列如SEQ ID NO.3。
(2)以实验室保存的质粒pETDuet-AldO为模板,其核苷酸序列为SEQ ID NO.2,P1和P2为引物进行PCR,通过PCR扩增得到含有天蓝色链霉菌Streptomyces coelicolor A3(2)来源的醛醇氧化酶AldO的基因片段。PCR扩增体系为:模板1μL,上下游引物各1μL,primerSTAR 25μL,ddH2O 22μL。PCR条件为:94℃5min,94℃30s,55℃30s,72℃90s,72℃5min,30个循环。PCR产物胶回收后,采用Sal I和Sac I双酶切再次胶回收,获得目标片段。以质粒pETDuet-TXC为模板,采用Sal I和Sac I双酶切胶回收得到骨架。加入2μL骨架,1.5μL目标片段,1μL T4 buffer,0.5μL T4 ligase、5μL ddH2O于16℃金属浴过夜连接。转化E.coli JM109,菌落PCR筛选阳性转化子。挑出2个阳性转化子接种到LB液体培养基中,37℃,培养12h,交由上海生工进行测序,测序正确表明基因工程菌pETDuet-TXAC构建成功。将重组质粒pETDuet-TXAC转化E.coli BL21(DE3)。筛选阳性转化子后获得基因工程菌pETDuet-TXAC BL21(DE)。
表一引物
引物名称
序列
P1
GAGCTCATGAGCGACATCACCGTTAC
P2
GTCGACAGAACCTGAGCCTGAGCCCGCCAGCACACCGCGC
实施例2:醛醇氧化酶二聚体酶的发酵与纯化
(1)将实施例1最终获得的基因工程菌pETDuet-TXAC BL21(DE)接种于含10μg/mL氨苄青霉素的TB液体培养基中,37℃,200-220rpm培养12-16h;按1-2%的接种量转接到含10μg/mL氨苄青霉素的TB液体培养基中,先于30℃、200-220rpm,培养3-5h直至600nm处的光密度值达到0.4至0.8时,加入终浓度为1mM异丙基β-D-1-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)进行诱导,16-18℃、200-220rpm,培养20-24h。
(2)发酵液于10000rpm,4℃条件下离心10min,收集沉淀,用重悬液重悬菌体,重悬液组成:20mM Na2HPO4、20mM咪唑、500mM NaCl、1mM DTT、0.5mM PMSF,pH 7.4,后经超声破碎后离心,上清即为醛醇氧化酶二聚体的粗酶液(如图一泳道一),首先采用Ni-NTA亲和层析对目标蛋白进行纯化,得到三条蛋白条带(如图一泳道二)。我们采用SEC分子筛对目标蛋白进行进一步分离纯化,第三条泳道为单一的目标蛋白条带,即成功获得纯化的醛醇氧化酶二聚体catAldO。经基因测序,醛醇氧化酶二聚体catAldO核苷酸序列为SEQ ID NO.1。
实施例3:醛醇氧化酶二聚体酶活力的测定:
采用比色法测定醛醇氧化酶二聚体酶活。在最适反应条件下,每生产1μmol H2O2所需用的酶量为一个酶活力单位。酶活测定条件:在55℃条件下,20μL 1mg/mL醛醇氧化酶二聚体纯酶液,10μL 1mg/mL辣根过氧化物酶(Horseradish Peroxidase,HRP),1470μL 0.1mM2,2'-联氮-双-3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸(2,2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonicacid),ABTS),500μL200mM甘油(D-山梨糖醇、D-甘露醇、L-阿拉伯糖、1,2-丙二醇)混合均匀后反应,通过紫外-可见分光光度法在线检测420nm处吸光度值。酶活的具体计算公式如下:
上式中ΔOD420为420nm处的吸收值变化;K表示酶液的稀释倍数;ε为毫摩尔消光系数(值为36L·mmol-1·cm-1);Vcell为比色皿中反应液的总体积;Venzyme表示加入到比色皿中酶液的体积,同一样品测量3次取平均值并计算标准差。
实施例4:催化特性
对纯化醛醇氧化酶二聚体(catAldO)进行催化特性方面的研究,具体见表2。可以观察到,catAldO对甘油的催化效率较出发菌株以及四突变株分别提高了78.4倍和7倍。以及catAldO对大部分糖醇类底物的亲和力以及催化效率均展现出不同程度的提升。
Km和Kcat的具体计算方法如下
酶相对于底物甘油的动力学常数:测定酶在55℃,50mM pH 8.0的PBS缓冲液中,对不同浓度的甘油(0~200mM)的催化活性。按照标准酶活力测定方法,于最适反应条件下反应,利用紫外-可见分光光度计连续监测一段时间内终产物吸光度值随时间的变化曲线如图2所示。取动力学曲线上线性段的始、终OD值,将吸光度值随时间的增加速率转化为底物浓度随时间的增加率(以μmol·min-1表示)
利用Origin 2019软件根据如下公式拟合曲线,得到Km与Vmax
上式中V表示反应初始速度,μmol/s;Vmax为最大反应速度,μmol/s;S表示底物浓度,mM;Km为米氏常数,mM。
酶的转化数(Kcat)可通过下式计算:
上式中Vmax表示最大反应速率,μmol/s;[E]表示蛋白浓度,μg/mL;V为酶体积,mL;Mr表示酶分子量,μg/μmol;
表二催化特性
源于Streptomyces coelicolor的醛醇氧化酶(alditol oxidase,AldO)具有宽泛的底物谱,对糖醇以及脂肪族、芳香族类1,2-偕二醇均具有一定的催化能力。本研究选取山梨糖醇、甘露糖醇、阿拉伯糖以及1,2-丙二醇为底物,测定catAldO的底物特异性,并确定了一些代表性底物的稳态动力学参数,结果如表二所示。首先catAldO对甘油的催化活性有较显著提高,其中,野生型AldO、四突变型AldO以及catAldO对甘油的展现出不同的底物特异性,Km值分别为350、111、52.1mM。catAldO相较于野生型酶和四突变体型的亲和力分别提升了6.7倍和2.1倍。并且catAldO对糖醇类底物的亲和力展现出10-24倍催化效率的提升。其中,山梨糖醇为catAldO最适底物,对其具有极高的亲和力(Km=0.09mM)。另一方面,周转率增加,这为所有底物提供了更高的催化效率。
实施例5:酶学性质
对纯化醛醇氧化酶二聚体(catAldO)与野生型及四突变型的醛醇氧化酶的最适反应条件以及稳定性进行比较,具体见表3。
表三
表三为本文catAldO与已报道的AldO相关研究中酶学特性的比较。
一方面,我们比较了hisAldO与catAldO最适反应条件,二者的最适温度较高,为55℃,并且在较宽温度范围(30℃~55℃)内,均能保持50%以上的活性。温度在40-60℃时,但对catAldO的活力影响较小,仍能维持80%活性。然而,当温度高于60℃时,两者酶活均呈下降趋势。总体而言,catAldO与hisAldO均呈现为嗜热酶的性质,有较广的反应温度范围。以及,hisAldO与catAldO最适pH为中偏碱性,分别为pH 7.0与8.0。pH对二者酶活影响显著,catAldO仅在pH 6~8范围内保持60%以上活力,而hisAldO仅在pH 6~7之间能保持60%以上活性,当pH偏离范围时,其活力均会显著下降。当pH值低于5或高于10时,二者均丧失活力。我们发现catAldO和hisAldO具有接近的最适反应条件,但是无论在何种反应环境中,catAldO的酶活力均明显高于hisAldO。
另一方面我们比较了hisAldO与catAldO的稳定性。研究结果表明,随温度的升高,catAldO的酶活性在40℃时达到最高。40℃至45℃,酶活缓慢下降。当温度高于此范围时,酶的稳定性显著下降,在55℃中孵育30min后二者均基本丧失酶活。在pH稳定性方面,hisAldO与catAldO在中偏碱性环境中具有良好的pH稳定性。其中,catAldO在pH6~10中孵育1h后,仍然能保持相对酶活80%以上,展现出较好的pH稳定性。但是,当pH值低于6时,catAldO的酶活基本完全丧失。hisAldO在缓冲液pH 6-9中孵育1h后仍能维持较好活性。
显然,上述实施例仅仅是为清楚说明本发明所做的举例,而非是对本发明的实施方式的限定。对于所属领域的技术人员来说,在上述说明的基础上还可以做出其他不同形式的变化或变动,这里无需予以穷举。但是,这些均属于本发明的精神所引伸出的显而易见的变化或变动仍处于本发明的保护范围之中。
序列表
<110> 华侨大学
<120> 一种醛醇氧化酶二聚体及其制备方法
<160> 4
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1882
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
agcccatatt gtcatggttg atgcatacaa gccgaccaaa ggttcaggtg ctagcggcgg 60
aggtggctca gaagccgcag caaaaggtgg aggaggctca acaggaggag aatatttcac 120
ccttcagatc cgtgggcgtg agcgcttcga ggagttccga gagaagaatg aggccttgga 180
actcaaggat gcccaggctg ggaaggagcc aggggggtca ggtgagctca tgagcgacat 240
caccgttacc aactgggccg gcaacatcac ctacaccgcg aaggaactgc tgcgtccgca 300
ctccctggac gcgctgcgtg ccctggtggc ggacagcgcc cgtgtgcgtg tgctgggcag 360
cggtcactcc ttcaacgaga tcgccgagcc gggcgacggt ggtgttctgc tgtctctggc 420
gggcctgccg tccgtggtgg acgtggacac cgcggcccgt accgtgcgtg ttggcggcgg 480
tgtgcgttac gcggagctgg cccgtgtggt gcacgcgcgt ggcctggcgc tgccgaacat 540
ggcctctctg ccgcacatct ctgttgccgg ttctgtggcc accggcaccc acggttctgg 600
tatgggcaac ggttctctgg cctctatggt gcgcgaggtg gagctggtta ccgcggacgg 660
ttctaccgtg gtgatcgcgc gtggcgacga gcgtttcggc ggtgcggtga cctctctggg 720
cgcgctgggc gtggtgacct ctctgaccct ggacctggag ccggcgtacg agatggaaca 780
gcacgttttc accgagctgc cgctggccgg tctggacccg gcgaccttcg agaccgtgat 840
ggcggcggcg tacagcgtgt ctctgttcac cgactggcgt gcgccgggtt tccgtcaggt 900
gtggctgaag cgtcgcaccg accgtccgct ggacggtttc ccgtacgcgg ccccggccac 960
cgagaagatg catccggtgc cgggcatgcc ggcggtgaac tgcaccgagc agttcggtgt 1020
gccgggtccg tggcacgagc gtctgccgca cttccgcgcg gagttcaccc cgagcagcgg 1080
tgccgagctg cagtctgagt acctgatgcc gcgtgagcac gccctggccg ccctgcacgc 1140
gatggacgcg atccgtgaga ccctggcgcc ggtgctgcag acctgcgaga tccgcaccgt 1200
tgccgccgac gcgcagtggc tgagcccggc gtacggtcgt gacaccgtgg ccgcgcactt 1260
cacctgggtt gaggacaccg cggcggtgct gccggtggtg cgtcgtctgg aggaggcgct 1320
ggttccgttc gcggcccgtc cgcactgggg taaggtgttc accgttccgg cgggcgagct 1380
gcgtgcgctg tacccgcgtc tggccgactt cggtgcgctg gcccgtgcgc tggacccggc 1440
gggtaagttc accaacgcgt tcgtgcgcgg tgtgctggcg ggctcaggct caggttctgt 1500
cgacatccca acgaccgaaa acctgtattt tcagggcgcc atggttgata ccttatcagg 1560
tttatcaagt gagcaaggtc agtccggtga tatgacaatt gaagaagata gtgctaccca 1620
tattaaattc tcaaaacgtg atgaggacgg caaagagtta gctggtgcaa ctatggagtt 1680
gcgtgattca tctggtaaaa ctattagtac atggatttca gatggacaag tgaaagattt 1740
ctacctgtat ccaggaaaat atacatttgt cgaaaccgca gcaccagacg gttatgaggt 1800
agcaactgct attaccttta cagttaatga gcaaggtcag gttactgtaa atggcaaagc 1860
aactaaaggt gacgctcata tt 1882
<210> 2
<211> 1257
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
atgagcgaca tcaccgttac caactgggcc ggcaacatca cctacaccgc gaaggaactg 60
ctgcgtccgc actccctgga cgcgctgcgt gccctggtgg cggacagcgc ccgtgtgcgt 120
gtgctgggca gcggtcactc cttcaacgag atcgccgagc cgggcgacgg tggtgttctg 180
ctgtctctgg cgggcctgcc gtccgtggtg gacgtggaca ccgcggcccg taccgtgcgt 240
gttggcggcg gtgtgcgtta cgcggagctg gcccgtgtgg tgcacgcgcg tggcctggcg 300
ctgccgaaca tggcctctct gccgcacatc tctgttgccg gttctgtggc caccggcacc 360
cacggttctg gtatgggcaa cggttctctg gcctctatgg tgcgcgaggt ggagctggtt 420
accgcggacg gttctaccgt ggtgatcgcg cgtggcgacg agcgtttcgg cggtgcggtg 480
acctctctgg gcgcgctggg cgtggtgacc tctctgaccc tggacctgga gccggcgtac 540
gagatggaac agcacgtttt caccgagctg ccgctggccg gtctggaccc ggcgaccttc 600
gagaccgtga tggcggcggc gtacagcgtg tctctgttca ccgactggcg tgcgccgggt 660
ttccgtcagg tgtggctgaa gcgtcgcacc gaccgtccgc tggacggttt cccgtacgcg 720
gccccggcca ccgagaagat gcatccggtg ccgggcatgc cggcggtgaa ctgcaccgag 780
cagttcggtg tgccgggtcc gtggcacgag cgtctgccgc acttccgcgc ggagttcacc 840
ccgagcagcg gtgccgagct gcagtctgag tacctgatgc cgcgtgagca cgccctggcc 900
gccctgcacg cgatggacgc gatccgtgag accctggcgc cggtgctgca gacctgcgag 960
atccgcaccg ttgccgccga cgcgcagtgg ctgagcccgg cgtacggtcg tgacaccgtg 1020
gccgcgcact tcacctgggt tgaggacacc gcggcggtgc tgccggtggt gcgtcgtctg 1080
gaggaggcgc tggttccgtt cgcggcccgt ccgcactggg gtaaggtgtt caccgttccg 1140
gcgggcgagc tgcgtgcgct gtacccgcgt ctggccgact tcggtgcgct ggcccgtgcg 1200
ctggacccgg cgggtaagtt caccaacgcg ttcgtgcgcg gtgtgctggc gggctaa 1257
<210> 3
<211> 114
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
ggaggagaat atttcaccct tcagatccgt gggcgtgagc gcttcgagga gttccgagag 60
aagaatgagg ccttggaact caaggatgcc caggctggga aggagccagg gggg 114
<210> 4
<211> 384
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
gcccatattg tcatggttga tgcatacaag ccgaccaaag ccatggttga taccttatca 60
ggtttatcaa gtgagcaagg tcagtccggt gatatgacaa ttgaagaaga tagtgctacc 120
catattaaat tctcaaaacg tgatgaggac ggcaaagagt tagctggtgc aactatggag 180
ttgcgtgatt catctggtaa aactattagt acatggattt cagatggaca agtgaaagat 240
ttctacctgt atccaggaaa atatacattt gtcgaaaccg cagcaccaga cggttatgag 300
gtagcaactg ctattacctt tacagttaat gagcaaggtc aggttactgt aaatggcaaa 360
gcaactaaag gtgacgctca tatt 384