本发明实施例提供一种轨道运输安全保障系统,包括机车安全辅助单元、监控监测单元和智能调度单元;所述机车安全辅助单元,用于在机车运输过程中进行速度检测、防睡检测、人员检测,并与调度室实时通讯,进行异常报警;所述监控监测单元,用于对巷道状况、巷道环境进行监控,并实时定位矿工人员、机车的位置信息;所述智能调度单元,用于对道岔进行监测、控制;基于机车运行起点和终点规划机车的轨迹行程,并基于所述轨迹行程和机车的位置信息调度运行方向上的道岔,使机车能够按所述轨迹行程运行,并在机车通过后复位对应位置处的道岔。从影响平巷机车运输安全的主观因素入手,建立运输安全保障系统,既保证运输中的安全性,又提高了运输效率。